> Son plan est en croix grecque inscrite. Elle est précédée d'un narthex et d'un exonarthex. Une fresque représentant la Vierge avec la dédicace Kyriotissa fut trouvée au-dessus de l'entrée du narthex et a donné son nom à l'église.
> Les parois de la nef sont couvertes de marbres multicolores, commes celles de Sainte Sophie et du Pantocrator. Les mosaïques au sol sont aujourd'hui recouvertes par les parquets et tapis. Sur les linteaux des deux piliers est, des sculptures du XIII-XIVe représentent la Deisis au nord, le trône du Jugement dernier au sud.
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Dans le parraclesion, aujourd'hui muré, ont été
trouvées les premières fresques connues sur Saint François
d'Assise, datant du milieu du XIIIe, et une mosaïque de la présentation
du Christ. Cette
mosaïque ainsi que les fresques de la Kyriotissa et de St François
sont exposées
au 1er étage du musée archéologique d'Istanbul.
